Protein–RNA interactions for Protein: P70158

Smpdl3a, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3aP70158 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpdl3aP70158 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpdl3aP70158 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpdl3aP70158 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpdl3aP70158 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpdl3aP70158 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpdl3aP70158 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpdl3aP70158 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpdl3aP70158 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpdl3aP70158 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpdl3aP70158 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smpdl3aP70158 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3aP70158 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpdl3aP70158 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms