Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp3P63024 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vamp3P63024 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms