Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RORCP51449 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RORCP51449 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RORCP51449 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RORCP51449 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RORCP51449 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RORCP51449 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RORCP51449 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RORCP51449 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RORCP51449 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RORCP51449 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RORCP51449 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RORCP51449 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RORCP51449 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RORCP51449 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RORCP51449 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RORCP51449 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RORCP51449 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RORCP51449 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RORCP51449 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RORCP51449 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RORCP51449 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RORCP51449 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RORCP51449 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RORCP51449 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RORCP51449 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RORCP51449 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RORCP51449 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RORCP51449 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RORCP51449 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RORCP51449 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RORCP51449 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RORCP51449 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RORCP51449 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RORCP51449 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RORCP51449 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RORCP51449 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RORCP51449 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RORCP51449 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RORCP51449 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RORCP51449 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RORCP51449 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RORCP51449 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RORCP51449 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RORCP51449 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RORCP51449 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RORCP51449 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RORCP51449 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RORCP51449 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RORCP51449 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RORCP51449 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RORCP51449 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RORCP51449 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RORCP51449 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RORCP51449 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RORCP51449 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RORCP51449 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RORCP51449 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RORCP51449 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms