Protein–RNA interactions for Protein: P43243

MATR3, Matrin-3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3P43243 MYO1B-208ENST00000438652 542 ntTSL 515.88■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 PHF21A-211ENST00000529734 557 ntTSL 415.07■□□□□ 01e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 DOCK4-207ENST00000445943 5999 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.29□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-213ENST00000549375 1061 ntTSL 214.08□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-207ENST00000548710 558 ntTSL 413.39□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 HNRNPR-202ENST00000374612 2694 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 HNRNPR-203ENST00000374616 2691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 HDAC4-202ENST00000430200 578 ntTSL 312.83□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ALDH1L1-201ENST00000273450 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ALDH1L1-206ENST00000455064 3137 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ALDH1L1-203ENST00000393434 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ALDH1L1-210ENST00000472186 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 NSFL1C-210ENST00000553571 752 ntTSL 410.8□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 MYO1B-209ENST00000451437 1310 ntTSL 1 (best)10.73□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 AMMECR1L-201ENST00000272647 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 LRRC69-205ENST00000520099 1861 ntTSL 29.74□□□□□ -0.851e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 CLYBL-201ENST00000339105 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 AC006978.2-201ENST00000442800 666 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 UBE2Q2P1-207ENST00000561403 364 ntTSL 59.01□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-204ENST00000548377 552 ntTSL 48.27□□□□□ -1.091e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 PHF21A-218ENST00000532883 1051 ntTSL 58.01□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 PFDN1-202ENST00000507185 787 ntTSL 28□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 HNRNPR-207ENST00000470941 560 ntTSL 47.29□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 UBE2Q2P1-203ENST00000558251 595 ntTSL 37.04□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 HNRNPR-205ENST00000463552 837 ntTSL 46.86□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 HGD-202ENST00000466528 444 ntTSL 26.83□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 HNRNPR-208ENST00000476451 814 ntTSL 46.53□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 EPB41L2-227ENST00000531356 588 ntTSL 46.5□□□□□ -1.371e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 HGD-206ENST00000480862 656 ntTSL 26.5□□□□□ -1.371e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 MYO1B-211ENST00000471904 770 ntTSL 35.59□□□□□ -1.511e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.631e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 DOCK7-210ENST00000634223 681 ntTSL 54.53□□□□□ -1.681e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4.42□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 PHF21A-212ENST00000529782 561 ntTSL 44.06□□□□□ -1.761e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 LINC01176-201ENST00000414621 230 ntTSL 33.94□□□□□ -1.781e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 FOXJ3-208ENST00000454417 499 ntTSL 33.84□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 LRRC69-207ENST00000522144 415 ntTSL 23.13□□□□□ -1.911e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 PHF21A-203ENST00000524497 555 ntTSL 52.96□□□□□ -1.941e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-206ENST00000548654 546 ntTSL 32.95□□□□□ -1.941e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.951e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 PHF21A-215ENST00000531959 507 ntTSL 52.81□□□□□ -1.961e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 SPATS2-215ENST00000549538 570 ntTSL 42.17□□□□□ -2.061e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 DOCK7-229ENST00000637208 8283 ntTSL 55.78□□□□□ -1.483e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.523e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.663e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.73e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.713e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.753e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.753e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 REPS1-207ENST00000445570 2690 ntTSL 221.37■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 REPS1-220ENST00000531675 353 ntTSL 520.55■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 REPS1-210ENST00000483468 6069 ntTSL 220.03■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 REPS1-216ENST00000529597 2468 ntTSL 512.43□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 TBC1D5-213ENST00000434420 386 ntTSL 44.17□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 27.8
MATR3P43243 CMSS1-202ENST00000463526 397 ntTSL 316.74■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 CMSS1-208ENST00000496116 2145 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 CMSS1-201ENST00000421999 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 CMSS1-206ENST00000491299 881 ntTSL 59.39□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 BUD23-203ENST00000421744 895 ntTSL 220.56■□□□□ 0.883e-8■■■■■ 27.8
MATR3P43243 TMEM135-204ENST00000526733 496 ntTSL 219.6■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 TMEM135-206ENST00000529023 1095 ntTSL 26.76□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 TMEM135-208ENST00000531800 201 ntTSL 52.73□□□□□ -1.972e-7■■■■■ 27.8
MATR3P43243 ELF2-208ENST00000511006 1434 ntTSL 1 (best)24.31■■□□□ 1.482e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 MIPOL1-202ENST00000396294 6258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 MIPOL1-211ENST00000556451 2282 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.793e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -23e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.021e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 RGS5-210ENST00000531954 581 ntTSL 48.54□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 27.7
MATR3P43243 RGS5-213ENST00000427213 616 ntTSL 37.81□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 27.7
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