Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13aP19253 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms