Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kcna1P16388 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcna1P16388 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcna1P16388 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcna1P16388 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms