Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SNRPBP14678 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPBP14678 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms