Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa1P11477 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa1P11477 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa1P11477 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa1P11477 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa1P11477 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa1P11477 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa1P11477 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa1P11477 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa1P11477 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa1P11477 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa1P11477 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa1P11477 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms