Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Apaf1O88879 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apaf1O88879 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms