Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3QKU1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3QKU1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3QKU1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3QKU1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3QKU1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3QKU1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3QKU1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3QKU1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3QKU1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3QKU1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
J3QKU1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3QKU1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3QKU1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3QKU1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3QKU1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
J3QKU1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3QKU1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3QKU1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3QKU1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3QKU1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3QKU1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3QKU1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
J3QKU1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
J3QKU1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
J3QKU1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3QKU1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QKU1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QKU1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QKU1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QKU1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QKU1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QKU1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QKU1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QKU1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QKU1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QKU1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QKU1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QKU1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QKU1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QKU1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QKU1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QKU1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QKU1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QKU1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QKU1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3QKU1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3QKU1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3QKU1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3QKU1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3QKU1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
J3QKU1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
J3QKU1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
J3QKU1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
J3QKU1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
J3QKU1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
J3QKU1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
J3QKU1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QKU1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QKU1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QKU1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QKU1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QKU1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QKU1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QKU1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QKU1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QKU1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QKU1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QKU1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
J3QKU1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
J3QKU1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
J3QKU1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
J3QKU1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QKU1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QKU1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QKU1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QKU1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QKU1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QKU1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QKU1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QKU1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3QKU1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3QKU1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3QKU1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms