Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm340F6RGI3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm340F6RGI3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm340F6RGI3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms