Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIGD1CA8MV81 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1CA8MV81 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms