Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms