Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2BQ99453 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms