Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3AQ96ST3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms