Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
OPALINQ96PE5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
OPALINQ96PE5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms