Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms