Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF2Q8IX21 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms