Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TMEM259Q4ZIN3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TMEM259Q4ZIN3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TMEM259Q4ZIN3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TMEM259Q4ZIN3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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