Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH18Q13634 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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