Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIN1Q05586 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms