Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPAP53621 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPAP53621 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPAP53621 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPAP53621 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPAP53621 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPAP53621 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPAP53621 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPAP53621 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPAP53621 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPAP53621 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms