Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms