Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REREQ9P2R6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REREQ9P2R6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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