Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms