Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms