Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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USP47Q96K76 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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USP47Q96K76 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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