Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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