Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NKD2Q969F2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms