Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDZD4Q76G19 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms