Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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