Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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