Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PTP4A2Q12974 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTP4A2Q12974 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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