Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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