Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms