Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP15Q9Y4E8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP15Q9Y4E8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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