Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRIT1Q9P2V4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRIT1Q9P2V4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIT1Q9P2V4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIT1Q9P2V4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIT1Q9P2V4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIT1Q9P2V4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRIT1Q9P2V4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRIT1Q9P2V4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIT1Q9P2V4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRIT1Q9P2V4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIT1Q9P2V4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms