Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kdm4aQ8BW72 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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