Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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