Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TCIRG1Q13488 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms