Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms