Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GGCXP38435 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms