Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA7P31268 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms