Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRABP1P29762 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms