Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZBED1O96006 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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