Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC9O60706 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCC9O60706 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms