Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COCHO43405 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COCHO43405 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COCHO43405 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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