Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms