Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP3K4Q9Y6R4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms