Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms